神の加護を受けた聖都オシャンティ……だが、実際はごく一部の人間だけが恩恵を受け、多くの住民たちは圧政を強いられていた。そんな中、スラム街の廃教会に聖女が現れる。彼女の名はエクリプス。強力な癒しの力を持ち、貧しい人々を無償で救う偉大なる聖女。

聖女エクリプスには秘密があった。大陸全土に広まる最高神オシャンティ信仰は、実はエクリプス自身が二千年前に黒歴史としてテキトーに考えたものだった。エクリプスは、信仰の力を得られなくなった本来の神々に呼び出され「責任取ってよね！」とハチャメチャに怒られる。

こうしてエクリプスは聖女として転生させられ、自分が作ったオシャンティ教を破壊する異端の聖女として振る舞うことに。だが、そんな彼女を権力者が放置しておくはずがない。

がんばれ聖女エクリプス！　神や悪魔や権力者に支援されたり妨害されたりしつつ、存在しない最高神オシャンティを倒すのだ！