舞台は2023年、国民が安全の為、銃を持つことが当たり前になった日本。
そこに住む17歳の青年である高原愛人は、特異体質や超能力者、常人を凌駕する身体能力を持つ者たちが集められ、警察官や特殊部隊にも手が負えない凶悪犯罪者を取り締まる日本のエリート超人集団
『警視庁公安部　公安第０課　　　通称：公安０課』
に所属する捜査官であったが、とある事件をきっかけに退職。姉のスネをかじって引きこもり生活を送っていた。

引きこもり生活を送って一年近くが経ったある日、姉の一言から高校に編入学する事になる。
『東京軍事育成機関学校　高等部』
そこは、特異体質を持つ者、魔術師、魔術技師、自衛隊や警察官と言った職を目指している者が集められる小中高一貫の学校であった。