中学時代にいじめられっ子だった楠木裕也（くすのき ゆうや）は、高校になってからは平穏な日々を過ごしていた。だがある日、高校からの帰り道に中学時代のいじめの主犯格に見つかり、ボコられてカツアゲされてしまう。
　一方、世界では「ダンジョン」が発見されるという大事件が起こり、同時に「探索者（シーカー）」と呼ばれる特殊な力を持った人々が現れ始める。探索者は「モンスター」を倒すことで「レベル」や「ステータス」といった能力を高めることができる異能者たちだ。
　裕也もまた、探索者の力に目覚める。自宅の近くにダンジョンを発見した裕也は、家から持ち出した包丁を手に、ダンジョンに潜っていく。
　およそ一ヶ月後。再びカツアゲしようと男たちが裕也を取り囲むが、少年はひと月前とは打って変わって落ち着き払っていた。