総合魔術学院(Genera Magic Academy)。通称ＧＭＡ。
　魔術師の魔術師による魔術師のための教育研究機関であるそこには、今年も世界中から数多くの未来ある魔術師の卵たちが入学してくる。
　純粋な知識欲と好奇心から入学する者。家系的な義務から入学する者。明確な目標値を掲げて入学する者。技術をさらに磨くために入学する者。なんとなく入学する者。
　そして――学院に秘められし謎を解明するために入学する者。
　とある組織からの依頼で特待生としてＧＭＡに潜入した黒羽恭弥は、表向きは優等生を演じながら学院が隠している秘密の一つである〈全知の公文書〉――アカシック・アーカイブの調査を行うこととなっていた。
　だが、同じ目的で入学した者は恭弥だけではなかった。
　協力し合える者。敵として立ち塞がり争う者。傍観し漁夫の利を狙う者。
　一冊の全知万能の書物を巡り、様々な魔術師が様々な思惑が交差する。