宇宙空間を移動しながら様々な構造物を建築する巨大な宇宙船　≪宇宙蜘蛛≫
そこで働いていた、電子システム整備士の渋川シュン。
謎の事件が起こり、意識が戻ったら艦内のあらゆるシステムはダウン状態だった。
異常に少ない生存者と接触するも、謎の怪物の襲撃を受ける。
超空間跳躍の失敗事故に似た怪現象が続く中、シュンは生きるために奮闘する。
他でもない整備士としての経験と力を駆使して。
仲間になったナイスバディの無口クール美女、なんか訳ありの様子。
力を貸してほしいと訴える船のＡＩ≪アラクネ≫が提示する情報をもとに怪物と戦っていく。
目標はシステム正常化と生存。
問題の原因となる船の最深部、果たして、そこには何があるのか？　
≪宇宙蜘蛛≫の真の目的は？
英雄でも兵隊でもない、ただちょっとむっつりで変わり者の整備士渋川シュンの戦いが始まる。